Magazyn danych (storage) jest logiczną jednostka definiującą miejsce przechowywania backupowanych danych. Magazyn może się składać jednej lub więcej ścieżek(lokalizacji) przy czym każda ścieżka, w obrębie jednego magazynu, jest ścieżką dla replikacji danych i nie zwiększa pojemności magazynu. System Xopero współpracuje z dowolnym typem magazynu, mogą to być pojedyncze katalogi na dysku, jak również urządzenia NAS czy duże macierze dyskowe.
Xopero nie wspiera bibliotek taśmowych LTO.
W przypadku konfiguracji wykorzystującej wiele instancji serwerowych, używany system plików musi wspierać konkurencyjny zapis.
Do tworzenia i zarządzania magazynami danych wykorzystywane jest narzędzie Management Center.